“夏亚的反叛”的第二次新吉翁战争12年后，宇宙世纪105年（U.C.0105），一个名为“马夫蒂”的反地球联邦组织开始以暗杀政府高官的方式对抗强权统治的地球联邦政府。该组织领导人马夫蒂·纳比尤·艾林的真实身份，是曾与阿姆罗·雷并肩作战的一年英雄布莱特·诺亚之子——哈萨维·诺亚。虽被展现奇异力量的少女琪琪·安达露西亚言语捉弄，但哈萨维仍为实现马夫蒂的目标而步步推进。与此同时，追捕马夫蒂的联邦军大佐凯奈斯·斯雷格收到了刑事警察机构汉德利·约克桑的密约提议。在哈萨维与肯尼斯各自为实现目标而行动时，琪琪亦为履行自己的使命，踏上了前往香港的旅程。
In an alternate present, genetically enhanced humans dominate society. Outcasts Leon and Chloe fight for justice against corrupt politicians exploiting genetic disparity, risking everything to challenge the oppressive system.
七个高中好友们在夜晚的海边庆祝自己的变化。升到高三的他们自此有了新的称呼，那就是“高考生”。这群考生包括林海风、伍月、小崔、苏杭、吴迪、上官撒丽和向虔飞七人。他们除了学业上的事，生活中也经历着青春期必经的烦恼。在第二天上学的途中，林海风经过海边，听到了小孩的呼救声，待他赶去营救时，发现小孩已被一个男人救起。更不思议的是，这个男人就是学校新来的老师鹿天。于是不像老师的鹿天和这群性格各异古灵精怪的学生开始了这最后一年的高中生活。一段段感动又励志的故事就此上演。
