马丁（罗伯特·雷德福 Robert Redford 饰）是一名计算机天才，20年前，他因为利用网络漏洞盗用公款而受到了警方的通缉，如今，他早已经金盆洗手改邪归正，和四个朋友成立了一家电脑公司。 某日，国安局的探员找到了马丁，希望马丁能够参与到一场行动中，盗取由编程专家戈登（蒂莫西·布斯菲尔德 Timothy Busfield 饰）所发明出来的解码器——黑盒子，传说中，世界上没有任何一个密码能够逃脱的了被黑盒子破解的命运。在国安局的威逼利诱之下，马丁一行人只得接下了这个任务，并且顺利的取得了解码器，哪知道第二天，报纸上就登出了戈登被谋杀的新闻。
2015年，朋友派出的恶魔推销员遍布世界各大主要城市，致命的病毒就此蔓延，全球愈20亿人丧命。在此之后，朋友开发出的疫苗拯救无数绝望的生灵，他再次被人类奉为神明，朋友帝国的统治进一步加强。 与此同时，以义常（香川照之 饰）为首的“贤知一派”和神奈率领的“冰之女王军”与朋友及其地球防卫军接连展开对抗。在被高墙封闭起来的东京，朋友做出新的预言，“2017年8月20日这天，外星人将来到地球散播更为致命的病毒，全人类都会因此灭亡”。人类危在旦夕，革命军加紧部署，阿区（丰川悦司 饰）、贤知（唐泽寿明 饰）、青蛙仔（宮迫博之 饰）、丸夫（石塚英彦 饰）也相继回到这里。关系人类命运的最终决战即将展开…… 本片根据浦泽直树同名漫画改编，影片简介中涉及的人名均以原著漫画中文版翻译为准。
《庞尼因·塞尔文:第二部分》揭示了前作中朱罗王朝内忧外患的源头：阿迪亚王子和楠蒂妮之间一段凄美的爱情悲剧。朱罗王朝年轻的王子阿迪亚和孤儿楠蒂妮青梅竹马，彼此相爱，然而王室为了拆散他们，流放了年轻的楠蒂妮。 公元978年，楠蒂妮决意为战死的潘地亚国王向王子和他的父亲孙陀罗国王复仇。为了深入朱罗朝廷，她嫁给了朱罗王朝的财政大臣。财政大臣伙同其他朝臣密谋另立国王的兄弟马杜兰塔卡姆为新王，以取代王储阿迪亚王子。潘地亚人誓要灭绝朱罗王族，他们率先向小王子庞尼因·塞尔文下手，但王子在海上突遇风暴，下落不明。听闻王子被大海所吞噬，王叔马杜兰塔卡姆自称为王位继承人夺取政权，并获得了外邦的支持。密林中，潘地亚人谋划着他们对朱罗王朝最后的致命一击，而楠蒂妮决心亲手杀死阿迪亚王子……
