第一季动画《薄樱鬼 第一季》讲到土方带领新选组转移到江户， 因为时代变更，战斗的武器由传统的武士刀变为了枪。在历史的推动下，新选组的各位也有所变化。第二季最大的看点无疑是各个人物都“改头换面”，穿上洋装，剪短头发。动画走的是土方线是最为艰辛，最为伤感的一条线路，因为土方作为德川幕府和武士道精神直至最后一刻的末代武士的代表人物，不论漫画还是史实上土方都是见证了新撰组由盛到衰的全部，其中包括了近藤勇的斩首，冲田总司的病死，还有其他战友的战死，可以说制作方选择土方线进行制作是花了不少心思的
「……我没有名字。一片空无。你叫什么名字？」「我的名字是时崎狂三。」 失忆少女「空无」在所谓邻界之地清醒，邂逅了时崎狂三。 她跟着狂三来到一所学校，里面聚集了一群被称为准精灵的少女。 为了互相厮杀而齐聚一堂的十名少女，以及空空如也的校外人士少女。 「我是狂三的同伴兼诱饵……诱饵吗！」「是啊，不想当诱饵的话，虏饵也行。」 「不是一样的意思吗！」这是独树一格的时崎狂三另类故事。 好了——开始我们的新战争（DATE）吧
集境十八楼联盟企图攻占苦境。灯蝶利用太幻楼人事更替之际，阴谋夺权，成为楼主花影人，其後又成为十八楼的联盟主席，声势震撼武林诸派。其时魔域趁机蠢动，三途判也趁此机会挣脱天牢，并勾结半邪郎等恶徒，企图再度危害武林，中原武林纷争迭起。 紫锦囊、一休禅师、慈航渡、崎路人┅┅等侠义之士，为平息武林之纷争，奔走奋战，冒险牺牲与邪教恶徒相抗衡，陆续平定群妖，但其伤亡自不在话下。
