大卫旅行到多米尼加共和国出售从他不认识的父亲那里继承的房子。在那里，他将遇到玛丽亚，她将彻底颠覆他的生活。
某日，野原新之助（矢岛晶子 配音）正在公园里和风间（真柴摩利 配音）、妮妮（林玉绪 配音）等朋友们玩耍，意外遇见了一位名为金有久美子（钉宫理惠 配音）的神秘女子，久美子告诉小新，自己来自于遥远的未来世界，而彼时已经长大成人的新之助，正是自己的未婚夫。 跟随着久美子，小新一行人来到了未来，在那里，金友电机的社长，亦是久美子的父亲金有增藏手握大权，并且绑架了一直和自己作对的新之助。得知小新的到来会阻碍自己的计划，增藏派出了刺客，在强大的敌人面前，小新能否顺利救出新之助，并且帮助面前这个陷入了黑暗之中的世界重新找回光明呢？
《庞尼因·塞尔文:第二部分》揭示了前作中朱罗王朝内忧外患的源头：阿迪亚王子和楠蒂妮之间一段凄美的爱情悲剧。朱罗王朝年轻的王子阿迪亚和孤儿楠蒂妮青梅竹马，彼此相爱，然而王室为了拆散他们，流放了年轻的楠蒂妮。 公元978年，楠蒂妮决意为战死的潘地亚国王向王子和他的父亲孙陀罗国王复仇。为了深入朱罗朝廷，她嫁给了朱罗王朝的财政大臣。财政大臣伙同其他朝臣密谋另立国王的兄弟马杜兰塔卡姆为新王，以取代王储阿迪亚王子。潘地亚人誓要灭绝朱罗王族，他们率先向小王子庞尼因·塞尔文下手，但王子在海上突遇风暴，下落不明。听闻王子被大海所吞噬，王叔马杜兰塔卡姆自称为王位继承人夺取政权，并获得了外邦的支持。密林中，潘地亚人谋划着他们对朱罗王朝最后的致命一击，而楠蒂妮决心亲手杀死阿迪亚王子……
