《如意兔之红晶石》主要讲述了为保卫 天城 家园，阻止冥王堡人掠夺天城“ 红晶石 ”宝矿的阴谋，守宝家族的水爷爷秘密地将开启宝矿的5件法宝分别交给了火龙、金灵、水花、木瓜和土生。从此这5个少年与天城命运和宝矿存亡紧紧相连。其次，金灵就是冥王堡的公主。勇敢的“五行少年”经历种种困难，并且还让天城人醒悟了，原来懦弱、自私的如意兔市民站了出来，依靠团结最终打败了冥王堡人，保住了天城自己美丽的家园。在主人公历经艰难曲折的保卫战中，让观众受到了环境安全、城市安全的大安全教育，同时也揭示出了保护绿色环境的深刻主题。
“想洗清嫌疑，方法有很多，语言辩解只是其中的一种，但也是最无力的一种。实力也是一种辩解的方法！” 紫川秀，这位在魔族大营内孤身击杀紫川家叛徒的将领，在远东地区神秘圣庙守护长老的支持下，成为了远东地区数十万联合部队的首领。一位新的远东之王——光明王，诞生了！
近未来の東京。車は列なり、電車が走り、ひっきりなしに人々が行き交う、何気ない日常の光景が繰り広げられている。街の上空に突如現れる黒い点。その点は見る見る大きさを増していき、街を飲み込んでいく。車も、電車も、そして人々も――。東京は直径数十キロもの黒いドーム、ブラックポイントに覆われた。拡大を止めたブラックポイントの間近。ギリギリ飲み込まれるのを免れたスカイツリーが屹立している。異様な光景を前に呆然としている人々。――と、ブラックポイント中から何かが近づいてくる。いつ果てるとも知れない絶望の中で、人々はブラックポイントより来たりし者を『Zillions of enemy X』、ゼクスと呼んだ―
