打倒“妖神颂五力”的三年后，马场柠檬已经是国中生。某日，阿拉拉城空中突然出现了巨大奇怪物体…
When a prehistoric Sponge is unfrozen, he causes chaos all over town - and only SpongeBob can communicate with him! When a flock of clams descend on Bikini Bottom, SpongeBob has to get them out before they ruin the whole town!
深月绫进入了以淑女教育著称的黑美女子学院，意外发现校内备受瞩目的“白百合大人”——夜绘美绪，在无人的教室里沉迷于格斗游戏。由于校规禁止游戏，美绪要求绫严格保密。然而，再次相遇时，美绪识破了绫同为游戏玩家的身份，并恳求与她一较高下。面对美绪对游戏纯粹的热情，绫虽心生抵触，却未表现出理解她为何放弃游戏的态度，最终接受了挑战。在较量中，两人作为稀有的女性格斗游戏玩家，逐渐理解彼此，建立了深厚的友谊。随后，她们冒着被退学的风险，与同为隐藏游戏爱好者的前辈一之濑珠树和犬井夕一起，更加投入地沉浸在格斗游戏的世界中。
重返奇妙世界，探索浩瀚宇宙，罗莎塔公主、酷霸Jr.、耀西等更多惊喜角色登场，开拓更宏大酷炫的版图，呈现更精彩纷呈的冒险。
游戏设计师昊宇穿越进自设游戏，凭造物主般实力折服林晓，联手主播富坤组成 “夜龙” 铁三角。为救重病母亲争夺呼吸机，闯险境横扫校际赛场，强忍穿越后遗症对抗暮鸦会，力克内鬼强敌，拿下世界赛资格踏上全新战场。
