《星际之门：宇宙（Stargate Universe）》的设定是人类在成功揭开星际之门第九个符号的秘密之后，一组探险队员被传送到荒废已久的古人飞船 "命运号" 上。这艘飞船是古人在其文明达到顶峰的时候建造的，它是古人的一次重大实验，承载着一项重要任遗憾的是，这个实验始终未能完成。 探险队员很快发现他们被困在了 "命运号" 上，无法通过原路返回地球。他们只有登上 "命运号"，向未知的宇宙深处出发。一路上，船员们将与古人先前向宇宙发射的星际之门一一取得联系，实现 "命运号" 最初的任务。这些星际之门在 "命运号" 被建造之前几个世纪就已被安放好了，"命运号" 能与其航向同步的时间窗口很短。一旦错过了其中一个，回头再找已经很困难了。此外，"命运号" 在旅途中还将遇到无数新的种族、敌人和奇闻趣事。
故事发生在2369 年，深空九号太空站本来是卡达西人占领贝久后所建造的采矿太空站﹝原名「Terok Nor」﹞，一直到资源全被卡达西人掏空后，卡达西人留下了这个采矿站离开，贝久人因为资源不足无法重建自己的家园，只好向星际联邦求助。太空站由星际联邦与贝久星共同管理，并更名为「深空九号」，于是它变成了联邦最偏远的太空站。 在第一集里太空站附近发现一个稳定的虫洞，可以迅速地往返遥远的Gamma象限。这个发现瞬间让这个太空站成为星际联邦最有价值的太空站，也成为进入这个广大未开拓宇宙空间的重要商业中心和军事重地。虽然电视指南（TV Guide）认为《深空九号》在「演、编、制以及整体而言都是最好的星舰系列剧集」，然而很多传统星舰迷一开始并不能完全接受它，有人说它背弃了星舰原创人吉恩罗登贝瑞的原始构想，不过根据报导，罗登贝瑞在死前认可了这个剧集的概念。 「DS9」颠复了以往Star Trek系列对未来世界过分理想化的描述，它是由一个废弃的采矿站加上默契欠佳的成员所组成的，而且由于深空九号太空站的地理位置和特殊的外交，站长偶尔就必须在有意无意间忽视或违背星际联邦的「最高指导原则」，在这许多不完美的条件下，发展出新的风格和管理的方式。「DS9」里所刻划的星舰时空是一个介于银河里各个大国之间的强权政治时代，基本上「DS9」偏重于探讨战争、宗教、政治妥协以及其他现代议题等等，很多人性的黑暗面都会在剧集中表露无疑，然而对于外来种族执意的侵略，为了保护联邦无辜的公民，星际联邦只好让战争在边境发生，这场战争打了四年，「DS9」后期的剧情就以这场「自治同盟战争」为主轴，主角们也渐渐获得成长，和一开始成员间的不协调已经完全不同了。
As Leo's replacement Thomas Chamberlain arrives Nikki investigates the murders of Rachel Freedman, shot in the head, and her little autistic son Nathan, who was poisoned. Nikki rejects policewoman Anne Burchett's theory that Rachel killed them both but is perturbed when an impostor, claiming to be Rachel's sister, visits the morgue. At the same time the disfigured corpse of Eva Liron is discovered, killed with the same poison as Nathan. She had been the nanny to French hot shot footballer Isaac Dreyfus and was planning to blackmail him over a sex tape of them both. Jewish Isaac is a controversial figure due to his anti-Muslim sentiments but he denies ant part in the murders. Then another victim, Isaac's agent Mousa, is discovered dead.
巫月族医女阿昭（曾宥臻 饰）身为神女后人却不知情，偶遇并爱上蒲罗国君应都（范晓东 饰），却目睹他屠戮族人与至亲。可回溯时间的风舞镯让两人经历三世轮回，阿昭最终查清所有真相，对抗天道对神女的禁情枷锁，成功破除宿命，与应都终成眷属。
