你有没有想过,没被吃完的食物会去哪里? 被浪费掉的食物其实会来到一个只属于食物的世界,它被称作“好东西城”,食物在这里得到清洗、消毒和修复,接着又回到人类世界“上班”,重复出现在人类的碗里!红小豆就是这样日复一日没被吃掉的一颗红豆,然而这天意外发生了!有一个人类食物中毒,而红小豆成为了那个被食察局怀疑的对象……
30年前,未知的“侵略性外来生物”突然出现,世界曾一度濒临毁灭。人类与这些被称为“侵略种”的生物相互争夺生存空间。虽然目前人类的安全勉强得到了保障,但世界随时可能走向终结。人们在恐惧死亡与毁灭的同时,只能对危险和灾难视而不见,麻木地过着日常生活。在这样的世界里,联合国危险生物调查机构“EXCEEDS”为了抵御“侵略种”带来的危机与灾害,开始了行动。故事的开端位于远东的岛国“瑞穗”。一位在离岛上生活、以驱除“侵略种”为业的猎人少女——久濑椎名。她唯一的愿望就是与家中唯一的亲人妹妹刹那平静地生活下去。然而,降临在椎名身上的事件究竟是——?