时期是大正末期。
日本作为军事国家不得不与世界争斗，激烈的时代。
主人公柊京一郎升学到帝国大学，向帝都东京出发。为了学习而迈进，为了家乡而决心成为一名出色的人物的京一郎，却因为自身特别的力量引起了军部——大日本帝国军的注意。
变得能看见死去的人类——死灵发生于京一郎患了大病的幼时。从那时起对于京一郎而言死灵一直是恐惧的对象，而军部却将其作为对抗外国威胁的力量加以利用。
军部与意图阻止其计划的人们的对立，牵连了京一郎的命运，改变着帝国的未来——
平凡的高中，平凡的部员们。 “我的特点”是什么？ “我的归处”又是什么？ 少女们为了探究这些暧昧的问题，为了实现“不太一样的高中生活”而奋斗，并一点点地成熟起来。 充满现实感的青春高中社团活动喜剧从此开始。
1998年夏季，拥有预测型未来视的女孩濑尾静音（井口裕香 配音）邂逅伽蓝之堂的黑桐干也（铃村健一 配音）。从对方口中，她了解到未来视的真相，心中的疑惑和焦虑也烟消云散，但同时也看到了干也悲剧性的未来。另一方面，拥有测定型未来视的职业炸弹狂魔仓密目琉夏，利用自己构建的未来制造一系列恐怖袭击事件，直到他遭遇冷静干练的两仪式（坂本真绫 配音），命运的齿轮开始转动。转眼来到2010年，失去了未来视能力的瓶仓光瑠（石田彰 配音）转行做了绘本画家，命运安排他和两仪式及其女儿未那（金元寿子 配音）相逢，此后他和崇拜自己的未那拜访了传奇占卜师观布子之母…… 本片根据奈须蘑菇以及武内崇创作的同名原作改编。
近未来の東京。車は列なり、電車が走り、ひっきりなしに人々が行き交う、何気ない日常の光景が繰り広げられている。街の上空に突如現れる黒い点。その点は見る見る大きさを増していき、街を飲み込んでいく。車も、電車も、そして人々も――。東京は直径数十キロもの黒いドーム、ブラックポイントに覆われた。拡大を止めたブラックポイントの間近。ギリギリ飲み込まれるのを免れたスカイツリーが屹立している。異様な光景を前に呆然としている人々。――と、ブラックポイント中から何かが近づいてくる。いつ果てるとも知れない絶望の中で、人々はブラックポイントより来たりし者を『Zillions of enemy X』、ゼクスと呼んだ―
