第二部里，张大勇（陶大宇饰）与李忠义这对默契排档继续与狡猾凶狠的罪犯斗智斗勇。感情方面，大勇与高婕（郭可盈饰）成为斗嘴情侣，感情稳定增长。新来的女警员蓝嘉文（郭霭明饰）单纯善良，暗恋大勇并主动示爱。令大勇和高婕的问题出现新的危机。此时，高婕发现嘉文过去曾在外国因为三角恋而放火杀人，正当要揭发这一段过去时，高婕的朋友离奇被杀。嘉文对过去的矢口否认也不像假装，大勇与高婕的误会加剧，事情的真相扑朔迷离。
北镰仓有一个名为法门寺的家族，由于是贵族后裔，当时的统治者一直隐瞒着他们的存在，即便如今知晓他们的人也极其有限。法门寺一族多年来一直潜心钻研各种学问，其中包括一系精通犯罪知识的学究派。而该学派长男更是代代遗传，拥有246的超高智商。如今的89代传人沙罗驱（织田裕二）也毫无疑问，是一名智商246的天才。每天都觉得无聊，想找点值得自己解决的谜团来打发时间的天才，莫名其妙被派去保护沙罗驱的庶民刑警和藤奏子（土屋太凤），法门寺家第89代管家贤正（藤冈靛）以及法医学怪人兼监察医森本朋美（中谷美纪），将为您破解怎样的疑难案件呢，尽请期待。 （萤萤@追新番原创翻译 转载请注明出处）
改变自坂上泉的小说《渚之萤火》。故事发生在返还协定生效前的琉球岛。1972年春天，派遣至警视厅的刑警真荣田太一（高桥一生饰）回到琉球警察本部任职。刚就任就碰上了岛内回收美元的运钞车遇袭，车内100万美元失窃的大案。真荣田能否顺利解决此次的强盗案件、抓获潜伏在岛上的美元大盗？
受人尊敬的正义法官秦誉（张家辉 饰），为掩盖儿子交通肇事逃逸真相，不惜将自己拖入罪恶深渊，在法官职责与父亲身份间陷入两难，高级督察唐萱（胡杏儿 饰）在调查中发现端倪，逐步揭开案件背后隐藏的父爱牺牲与程序正义的冲突，一场关于父爱与正义的终极博弈就此展开。
中国南方一个省级电视台，身为新闻部副主任的吴嘉俊（陈宝国 饰）从美国请回了女友白芸（周海媚 饰）和师弟陶翔（高曙光 饰）加盟，但是随之而来的却是一连串的台内政治和勾心斗角。新闻部正牌主任将二人视作吴的心腹，想方设法加以排挤。一厢情愿追求吴主任的女主播于莉莉则视白芸为眼中钉，肉中刺。白芸因妹妹恋爱失败的原因，也对陶翔怀有深深的敌意和戒备。坚忍自强的白芸决心通过自己的努力，在新闻行业做出一番成绩。缠斗的乱流中，吴主任死于一场意外，这让白芸倍受打击。 而在随后的工作中，她不仅和陶翔的矛盾误解逐渐打开，彼此心中似乎还多了一份难以言喻的感情……
