主人公岛村乔，某日被神秘的男人们抓住改造成了人造人。在世界的暗影中活跃着的死亡商人“黑幽灵团（Black Ghost）”为了制作划时代的新商品•人造人士兵的试验品，偶然地选择了乔。但是，乔被先前改造的8名人造人和改造他们的吉尔莫亚博士告知了当下的情况后，与他们共同从黑幽灵团逃走了。 他们在得知黑幽灵团的野心后便不断阻止敌方的行动，然而拥有着同样力量的人造人战士却只有他们。胸中怀着人类的心和机器所没有的悲伤心情，人造人战士们为了粉碎黑幽灵团的野心而不断地持续着战斗。
打倒“妖神颂五力”的三年后，马场柠檬已经是国中生。某日，阿拉拉城空中突然出现了巨大奇怪物体…
21世紀初頭。世界は謎の生命体の攻撃により、壊滅的な被害を受けていた。 主人公、亜納桂（アノウ・ケイ）達の住んでいる街も隔離閉鎖地域となり、絶えず自衛隊により警戒が続けられていた。ケイは、幼なじみの松戸ナオキと共に、政府公認組織と言われる【スピリッツ】の隊員募集に応募し、そこで謎の少女アマラと出会う。 彼女に惹かれていくケイ…。そんな中、ケイは「デヴァダシー」と呼ばれる謎のロボットのパイロットとなる。自衛隊では歯が立たなかった謎の生命体に、デヴァダシーが最終兵器として人類の存亡を賭け今、迎え撃つ!! 「天地無用」「神秘の世界エルハザード」など数々のアニメ作品で知られる“AIC”が贈る、新感覚SFアニメーション！ 謎の生命体の攻撃により、人類が絶滅の危機に瀕している世界。ケイは政府公認組織と言われる【スピリッツ】の隊員募集に応募。そこで謎の少女アマラと出会い、彼女に惹かれていく。そんな中、ケイたちは謎の生命体に唯一対抗できる「デヴァダシー」のパイロットとなり…。
近未来の東京。車は列なり、電車が走り、ひっきりなしに人々が行き交う、何気ない日常の光景が繰り広げられている。街の上空に突如現れる黒い点。その点は見る見る大きさを増していき、街を飲み込んでいく。車も、電車も、そして人々も――。東京は直径数十キロもの黒いドーム、ブラックポイントに覆われた。拡大を止めたブラックポイントの間近。ギリギリ飲み込まれるのを免れたスカイツリーが屹立している。異様な光景を前に呆然としている人々。――と、ブラックポイント中から何かが近づいてくる。いつ果てるとも知れない絶望の中で、人々はブラックポイントより来たりし者を『Zillions of enemy X』、ゼクスと呼んだ―
