2002年，数码世界面临灭亡的危机！数码世界本是由究极天使兽、基路比兽及神圣天女兽三大天使所管治的，然而其中一位天使——基路比兽却叛变，这使得数码世界的平衡受到破坏，并开始崩溃…… 古代曾经拯救数码暴龙世界的十斗士现在已不存在。就在这危急关头，十斗士的斗士精神把新力量给予了另一个世界——现实世界的孩子…… 主角拓也等人，将进入数码世界，变身成数码暴龙，投入这场冒险与战斗的旅程！
集境十八楼联盟企图攻占苦境。灯蝶利用太幻楼人事更替之际，阴谋夺权，成为楼主花影人，其後又成为十八楼的联盟主席，声势震撼武林诸派。其时魔域趁机蠢动，三途判也趁此机会挣脱天牢，并勾结半邪郎等恶徒，企图再度危害武林，中原武林纷争迭起。 紫锦囊、一休禅师、慈航渡、崎路人┅┅等侠义之士，为平息武林之纷争，奔走奋战，冒险牺牲与邪教恶徒相抗衡，陆续平定群妖，但其伤亡自不在话下。
