故事发生在一个名为楢崎町的小镇上，这是一个拥有着神秘魔法力量的神奇小镇，在小镇的天空中，永远都挂着一道绚丽的彩虹，而在传说中，神明会实现居住在这个小镇里的人们每人一个愿望。 天海春彦（泰勇气 配音）是从小到大都生活自镇上的青年，一天，班上来了一个名为深峰莉子（清水爱 配音）的转校生，让春彦没有想到的是，这个女孩竟然是自己的义妹，他们在年龄很小的时候分开了，想不到命运的红线令两人于此时此刻重逢。莉子的出现让春彦的青梅竹马木之坂雾乃（宫崎羽衣 配音）感到了强烈的危机感，她一直默默的喜欢着春彦。
小仓夫妇19年前约定等孩子满20岁就离婚。完全忘记约定的丈夫小仓涉依旧我行我素地生活，而将此视为郑重承诺并以此为精神支柱的妻子小仓杏，则在日常生活中逐渐动摇。某个暴雨夜，因附近河流即将泛滥，夫妇与其他住户共度一夜，自此他们的日常生活开始悄然改变。
又是一年美好的圣诞节到来，芭比（Kelly Sheridan 配音）即将和妹妹凯莉（Amelia Henderson 配音）参加圣诞慈善舞会，可是凯莉却犯起了脾气。于是，芭比借助雪花球，为妹妹讲述了一个发生在维多利亚女王时代的故事。当时有一个美丽、骄傲的歌剧名伶伊甜·斯塔林（Morwenna Banks 配音），她自视甚高，讨厌圣诞节以及在节日期间演唱颂歌。剧团工作人员和演员们相处甚佳，但是大家都对尖刻傲慢伊甜忌惮三分。大家原打算庆祝平安夜，可是伊甜竟然要求大家全部留下来排练。没有人能够说服她改变主意，这个高高在上的女王用她的傲慢带给所有人不快。 这时，一个意外发生在了伊甜的身上，让她冰冷的灵魂发生些许改变……
2013年，瑞士的原子核研究机构“CERN”—— 在希格斯玻色子这一发现的暗影之下，某个秘密计划启动了。 这一计划的名称是“Niantic计划”。 其目的是研究干涉人类精神的未知物质。 被称为“奇异物质（XM）”的这种物质， 自古以来就感应着人们的精神及能力，甚至给人类的历史带来了极大的影响。 世界各国的机关暗中进行着这项研究。 XM被视为人类的希望或是威胁， 大国及巨大企业为此而爆发了争夺战。 接受XM的力量，并准备将其利用于人类进化的“启蒙军”。 将XM视为威胁，并准备控制它的“反抗军”。 世界划分为这两大阵营，至今仍在持续着争斗。 在这个世界发生的争斗背后，正是XM的存在。 之后，2018年——。 以东京和世界为舞台，围绕着XM的新战斗开幕。 将动画、在线位置信息游戏以及现实连结起来， 从未体验过的全新“增强现实娱乐”开始了。 。
