新学期刚开始，高中生·坂井悠二一如往常过着“日常生活”。然而有一天，他冷不防遭遇红世之王手下的侵袭。受到一名能够把人的存在化为灵火，并吸取灵火的神秘男子法利亚格尼的攻击。悠二的“日常”生活因此整个脱节，然而就在同一时间，一名少女出现在他面前。 少女为了保护悠二不被法利亚格尼袭击，开始与悠二一同生活。悠二满怀感激向少女道谢，不料少女却如此低喃：“你已经不存在了。” 我已经死了？存在丧失者·悠二为何还能够思考呢……
21世紀初頭。世界は謎の生命体の攻撃により、壊滅的な被害を受けていた。 主人公、亜納桂（アノウ・ケイ）達の住んでいる街も隔離閉鎖地域となり、絶えず自衛隊により警戒が続けられていた。ケイは、幼なじみの松戸ナオキと共に、政府公認組織と言われる【スピリッツ】の隊員募集に応募し、そこで謎の少女アマラと出会う。 彼女に惹かれていくケイ…。そんな中、ケイは「デヴァダシー」と呼ばれる謎のロボットのパイロットとなる。自衛隊では歯が立たなかった謎の生命体に、デヴァダシーが最終兵器として人類の存亡を賭け今、迎え撃つ!! 「天地無用」「神秘の世界エルハザード」など数々のアニメ作品で知られる“AIC”が贈る、新感覚SFアニメーション！ 謎の生命体の攻撃により、人類が絶滅の危機に瀕している世界。ケイは政府公認組織と言われる【スピリッツ】の隊員募集に応募。そこで謎の少女アマラと出会い、彼女に惹かれていく。そんな中、ケイたちは謎の生命体に唯一対抗できる「デヴァダシー」のパイロットとなり…。
