Muv-Luv ATE全名为《Muv-Luv Alternative Total eclipse 》，全集动画片改编自《Muv-Luv Alternative》的外传小说。故事的时间设定在西元2001年，由于人类遭到地球外起源种(联合国称其为BETA)的侵略，正面临灭亡的危机，因此人类开始了先进战术机技术开发计划“XFJ计划”，各个国家均派遣了专门人员参与其中，该作讲述的就是这些被派遣过来的人员之间的故事。 （有虫子吃掉妹纸情节,反差极大,请谨慎观看.）
从小到大，上杉练（关智一 配音）和姐姐上杉美鸠（北都南 配音）就生活在父亲暴力的阴影之下，终于，忍无可忍的两人选择了离家出走，可是，身无分文的两人在七滨市中几乎无法生存。一次偶然中，姐弟两人遇见了名门久远寺家的大小姐，出于同情，后者决定将两人带回自己的府邸中，担当管家与女佣的职位。 就这样，上杉姐弟两的新生活开始了。久远寺家有着三位女主人，分别是声名远扬的指挥家兼当家久远寺森罗（伊藤静 配音），个性傲娇但直爽的次女久远寺未有（后藤邑子 配音），以及里里外外都是少女心的久远寺梦（水森志寿香）。虽然这三个颇具姿色的大小姐经常让上杉练感到无所适从，但也是她们让上杉练明白，人间自有真情在。
少女小说家的高代槙生在姐姐夫妇的葬礼上，面对被亲戚们互相推诿的姐姐的遗孤·朝无法视而不见，顺势决定收养她。但是把侄女带回去之后，不善交际的槙生才发现自己不适合和谁一起生活。于此相对，不认生的朝面对“不像大人的大人”的槙生却也坦率的接受了。女王和如小狗般侄女就此展开了同居生活……
もう『器用貧乏』なんて言わせない！ いつか『万能者』と言われる探索者になってやる！ ある日のこと…… 所属している「勇者パーティ」のリーダーであり、幼なじみのオリヴァーから 実力不足を理由に追放を言い渡されたオルン・ドゥーラ。 パーティのために【剣士】から【付与術士】へとコンバートし、 独自に開発した魔術で仲間をサポートしてきたオルンにとっては到底、 納得のいくものではなかった。 しかし、苦楽を共にしてきたはずの仲間からも『器用貧乏』だとバカにされ、 すでに後任者も決まっているという。 失意のなか、「勇者パーティ」に別れを告げたオルンは探索者としての決意を新たに、 ソロ活動を始めるのだが……。 抜け落ちた記憶… 理不尽さへと立ち向かう力… 新たなる出会いの数々が、オルンの運命を大きく変える。 大切な仲間を護るため 究極の『器用貧乏』は、最強の『万能者』を目指して突き進む。 大逆転の異世界王道ファンタジーが開幕！
万族咆哮，撕裂苍穹！全面转职时代彻底降临！觉醒日，李一觉醒至高阴神职业——阴司至尊！生死簿翻页，万灵寿数由吾定；轮回盘转动，诸界亡魂归吾掌！十万鬼将，百万阴兵，一念断生，一念断死，诸天万界我为尊，吾意即天意！面对异族屠戮，人族悲歌响彻寰宇。
