以南葛中和东邦学园同时夺冠而落下帷幕的全国中学生足球大会。大会后，面向在法国巴黎举办的国际少年青年大会日本少年青年代表被选出了。除了发誓向世界飞跃的翅膀之外，日向、若岛津、若林、海角的海外组等最强的布阵。另一方面，以实力超过日本的世界足球大国也开始行动了。德国的施耐德、法国的皮埃尔、阿根廷的迪亚斯、意大利的赫尔南德斯等新的竞争对手们也为了获得世界第一的宝座而聚集在巴黎。
顶级武者步惊云与聂风，为了应对一场将要席卷整个人间的浩劫，在无名前辈和神秘天外来客的帮助下变成量子态后，下落不明。三千年后，一颗小行星撞击地球，地表成为一片荒蛮的废土。 被困在地下的人类，逐渐发现在人体内存在著名为"脉能"的超能力量。 来自32号地下城的孤儿步天云，意外唤醒了沉睡在陨铁之中的步惊云，从此发现了自己体内的“脉能”潜力，并与聂风传人聂子风一起，走上了成为“脉能武者”的历练之路，为守护世界而战。
