兄弟患难二十载，知人知面不知心……仇恨交织，展开一场激烈的厮杀

　　明朝中叶，倭寇不断骚扰东南沿海，东瀛柳生一族辅佐德川家康之余亦要席卷中原武林。于是“东瀛霸刀”柳生（任达华饰）杀入武林、所向披靡，亦要向中原武林第一高手“天剑”独孤无极（刘松仁饰）挑战。独孤无极正要与新婚妻子梦青丝（杨紫琼饰）成亲，却不得不为此事拖延。他向“鬼医”（吴孟达饰）求助，遂用剧毒将自己功力提高数倍。比武之日，独孤无极力战柳生，将其赶走，自己却被体内毒气错乱神经，以致糊涂杀死山庄里无数友人，并气走青丝。青丝自此男装打扮，化名独孤贞，杀尽天下负心人。
　　鬼医弟子吴通（张卫健饰）为了逃避年纪比他大许多的未婚妻牛娃（郑裕玲饰），成婚当日逃走，巧遇微服出游的天香公主（张曼玉饰）和贴身侍卫（吴君如饰），三人发生争执，此时独孤贞出现解围。而此时镇上却在传言梦青丝在妓院摆出迷魂阵召贤比武的香艳传闻，惊讶的独孤贞于是与吴通一起前去探个究竟......

　　纸扎店小工朱宏利（洪金宝 饰）自小由道士二叔公（林正英 饰）带大，朱宏利道术未习多少，行事偶而颠倒，却有一副正气心肠，因不肯拖累指腹为婚的未婚妻阿云（钟楚红 饰），时常给人家冷脸。朱宏利好友马麟祥（午马 饰）外出闯荡，返乡时却变成了一具尸体，一同回来的还有马麟祥怀孕的妻子跟几个男伴，朱宏利感事有蹊跷，出力调查却一无所获。几日后，马麟祥冤魂找到朱宏利求助，原来马麟祥返乡时并未身亡，只为伙同他人盗取自家祖上的陪葬品而出此下策，却不料假戏成真，被同伙取了性命。心灰意懒的朱宏利拗不过冤魂骚扰，请来二叔公做法帮好友报仇，结果自己丢掉了肉身以至丧命。悲痛欲绝的阿云经二叔公指点，欲与鬼差斗计抢回朱宏利的魂魄……

　　社团小弟阿华（黄宗泽 饰）、阿飞（张继聪 饰）、国仔（陈家乐 饰）奉老大花锦（郑浩南 饰）之命运送一笔社团资金，不料在运送途中遭遇埋伏，巨款不翼而飞…而花锦的死对头群哥（陶大宇 饰）以此为由兴师问罪，企图抢走花锦即将得到的龙头之位。一时间权利之争愈演愈烈，三兄弟也被迫卷入这场纷争之中。金钱和道义面前三兄弟会如何抉择？花锦与群哥的双雄对决又将鹿死谁手？

　　武当派败类白眉道人、冯道德、雷老虎等，勾结清廷，甘受驱使来残杀武林中人，方世玉之父母方济亨、苗翠花，胡惠乾之父皆为雷等所杀；胡一次 寻仇不遂，为方所救，后随方往少林寺练就高强武功，影片最后少林与武当之武林自相残杀的画面，出现一幕令人触目惊心的大结局。

　　江湖向来纷争不断，两大门派铁旗门和神鹰堂一直对立，都想将对方连根拔起。一日，神鹰堂的的堂主给铁旗门掌门铁麟（梁耀文 饰）发了一封请罪贴，邀请铁麟前往神鹰堂赴宴，以冰释前嫌，化解两派矛盾。铁麟认为这其中必然有诈，正想拒绝，但大弟子曹风（鹿峰 饰）则认为不如将计就计，杀他们 一个措手不及。铁麟认为有道理，于是带领一众弟子一起前往神鹰堂。果然，神鹰堂里十面埋伏，铁麟和弟子奋力将敌人一一击退，不料，意外发生了！