《万界神主》第109集即为《万界神主 第三季》第1集。
　　身为古神的叶辰从神境世界陨落到了苍蓝世界，这里百州千国林立，豪强争霸，叶辰在这个苍蓝世界呆了数百年，建立了庞大的势力。在百州千国，叶辰的存在一直都是一个传说。但是来自神境世界的力量慢慢地延伸到了苍蓝世界，一场残酷的龙争虎斗即将开展。南州都城，天北国第一战将洪旭与南州双月 门门主武隆二人在花神宫外比武，却不料败在花神宫丫鬟组小组长苏小小的手中，众人震惊。北狄大军出现在了南州东部，欲破南州。守将不顾南州百姓安危与斩风的劝阻，打算打开城门投降。花神宫宫主澹台月及时出现，以将北狄灭国为威胁，逼退率领北狄大军的雷帅。苏小小让武隆和斩风前往花神宫外门打杂。为了阻止战争的爆发，叶辰孤身一人前往北狄的途中，遇到了圣女——慕清雪跟他的随从。数百之多的北狄狼骑突然出现，将他们的去路完全封死。叶辰出手，打败了北狄的将军和狼骑，救下了慕清雪一行人。漫山遍野的火焰将他们包围在了雪地之中。叶辰急忙逃离，顺便带走了慕清雪。北狄国主托尔克汗为了花神宫一事，前往神冢祭坛，寻求老国师的帮助。老国师令托尔克汗持他的信笺，前往昊天宗，请昊天宗宗主出山。慕清雪回到了自己的家园当中，却发现自己的家园已经被摧毁。叶辰将慕清雪带入了先祖古墓之中。叶辰与慕清雪二人在洞穴之内发现了一艘拥有智慧的远古飞船——若琪。安琪和若琪在穿梭暗域世界的时候，被噬灵偷袭，生死不明。只有找到七份生命契约，这样才能让安琪复活。叶辰使用空间神力救助了大祭司。昊天宗等人闯入月影山庄，将一众花神宫的子弟杀害。苏小小出手，将昊天宗的执事打倒在地。谛听与苏小小等人对战。苏小小打算带上门人后撤。一路追踪苏小小等人的谛听，遇上了叶辰，反被打败。昊天宗毁了叶辰的月影山庄之后，手下死伤惨重。澹台月展开反击，不惜动用炼魂碎魄大阵，叶辰出手，将昊天宗宗主严鸿击败。而后叶辰才得知，昊天宗的幕后黑手其实是风雪女神安雪。叶辰和他的朋友们跟安雪斗智斗勇，并最终拯救了整个世界。

　　故事讲述了顶上战争两年后的香波迪群岛上，娜美的小迷妹展开的一场小小冒险……本作改编自航海王官方外传小说《航海王 novel 草帽故事集》，小说描述了以一般人的角度来看待草帽海贼团成员们的短篇故事。

　　史雷（木村良平 配音）虽然身为人类，却在天族的养育下长大。人类无法感知到天族的存在，可史雷却因为其拥有的强大灵力而让这两个格格不入的种族产生了交集。为了解开遗迹崩塌的谜团，为了推进历史的前进，史雷踏上了旅途，并且在误打误撞之中拔起了石缝中的圣剑，成为了净化凭魔的导师。
　　成熟冷静的米库里欧（逢坂良太 配音）、善良正义的少女艾利夏（茅野爱衣 配音）、开朗热情的罗洁（小松未可子 配音）、外表成熟个性却略显天真的莱拉（下屋则子 配音）、独来独往对人类缺乏信任的埃德娜（福圆美里 配音），一路上，史雷结识了一位又一位个性迥异的同伴，会有怎样的答案在终点等待着他们呢？

　　本田透是一个天真、善良、迷糊的高中女生，从小与妈妈相依为命。但一场车祸夺去了妈妈的生命，让小透成了一个孤儿，她带着全部家当搬到山林里，过起了林间独居的帐篷生活。在命运的安排下，小透无意中走进了一个古老大宅，邂逅了奇怪的男子草摩紫吴。原来他是草摩由希的表哥，而由希又是学校里一致公认的王子，这间大宅正是由希的住所。当天晚上林间土石塌方，小透所住的帐篷被土石掩埋，幸好由希和紫吴将她及时救出，让她暂时住进他们的大宅里。
　　草摩家族几百年的秘密被小透发现，由希、紫吴等人只要被异性拥抱，就会立刻变身为十二生肖中的对应生肖。另一个神秘的少年阿夹，不仅变身为猫而且还隐藏着这个家族中更大的秘密。草摩家族的当家人发令，必须消除知道真相的小透的记忆。而小透一句“就算我的记忆消除了，请你还是继续和我做朋友”感动了由希、阿夹等人，她更像一缕温暖的阳光，照亮了阴雾重重的草摩家族。