外太空镭射枪变态杀人狂光临美利坚，小镇居民面临灭顶之灾！

一名孕妇坠崖后醒来，不记得自己是谁，也不认得身边的朋友甚至自己的丈夫，但在恢复记忆的过程中她开始意识到一切绝非这么简单。。。

　　工程师詹宁斯（本·阿弗莱克 Ben Affleck饰）是个高科技天才。他屡屡受聘于各种项目研究，获得丰厚酬劳，但为了高度保密，条件是完工后他必须被删掉大脑中的短期记忆。此次詹宁斯的任务报酬达到了天价，而他必须花费长达几年的时间投身于这个新产品研发。                                                                    　　当产品完工后，令人意外的事情发生了。詹宁斯竟然没有得到承诺的报酬，取而代之的是一个信封，里面装着一封他自愿放弃酬劳

　　科学家们在一个小镇的供水系统中下毒，把居民变成杀人狂魔，他们互相残杀，任何人都能通过。

　　尚恩在另一个对比的地球担任重案刑警，不同的是那里的科技全都倚靠魔法运作。一次他着手调查一连串怪异谋杀案，犯案手法都是他过去从来未见，因为凭借是科学。他在雷诺，一名崇尚科学更甚于传说和童话的「实用主义」忠实成员，以及130岁的魔法师丘吉尔这两人的协助下，发现层层迂回的内幕，引领他来到另一个时空，也就是我们存在的地球。这时他才发现，如果他不出手阻止，两个地球都会面临毁灭。

　　随着科技的进步和发展，一种能让犯罪之人“改邪归正”的新型药物被研发了出来，一位名叫李（雷·利奥塔 Ray Liotta 饰）的死刑犯作为试验品接受了药物的注射，通过实验数据的监测，科学家们发现除了暴力倾向的逐渐消除外，李的内心里还对受害者盖瑞（Mark Pickard 饰）产生了愧疚之情，这也就意味着，李已经逐渐的转变成为了所谓的“好人”。实验组让李重新回归了社会，并进行着持续的监控。
　　随着时间的推移，李的生活渐渐走上了正轨，他不仅努力工作，还交了一位漂亮的女友。心中的愧疚让李打起了看望盖瑞的念头，然而，盖瑞的哥哥比尔（蒂姆·迪凯 Tim DeKay 饰）却不愿意原谅李，他不仅绑架了李，还打死了监控李的工作人员。工作人员的死亡让警方误以为李“本性难移”，一边是步步紧逼的追捕，一边是凶神恶煞的绑匪，腹背受敌的李会遭遇怎样的险情呢？

　　故事发生在美丽的志摩市。因交通意外失去母亲的小男孩相泽透，一天在好奇心的驱使下，在海岛上找到一块闪烁着红光的石头，上面还有一枚蛋。刚握在手里，从蛋里竟孵出一只小乌龟来，为了纪念母亲生前对他的昵称，小透给小乌龟起名为“透透”，并瞒着父亲孝介把透透养在家里。
　　平常在家里不爱说话的小透，由此一天天的开朗起来，这让孝介感到惊讶而欣慰。然而，事情并没有这么简单，这并不是普通的小乌龟，它不但生长速度惊人，而且还懂得制造气流在空中飞行，青梅竹马的邻家女孩西尾麻衣了解到这一切，她告诉小透，透透有可能是33年前以自爆方式拯救了志摩市的怪兽加美拉。后来，透透长大到实在没法遮掩，小透便把它搬进了海边一个秘密小屋。
　　麻衣原来一直有心脏毛病，翌日她将要到名古屋的大医院动手术。得知此事，小透决定要送给麻衣当地流传能带来好运的绯红色守护石，而这块守护石，正是透透出生时那块发出红光的石头窝，麻衣为此向“两个小透”都表示感激。
　　一天，小屋里的透透突然不见踪影，小透正要四出寻找，一头凶恶的蜥蜴怪兽积达士出现，不仅在市镇上大肆破坏，还掠食人类。孝介赶到现场，打算带儿子和他的小伙伴脱离险境，却不知积达士已经在背后张开了血盆大口。千钧一发之际，一个庞大身影闪过将积达士撞开，果然，透透就是年幼的加美拉。
　　只有成年体型四分之一的透透，经过苦战一场，终于把积达士打入大海，而自己也耗尽了力气，被政府内阁官员带同巨型生物审议委员会抓走，小透却只能眼睁睁的看着透透被军方押送离开。不过，坏消息随后带来了一个好消息：麻衣的母亲来电告诉小透，女儿的手术顺利完成，奇怪的是，麻衣在梦中却一直念叨着要把守护石还给透透。
　　学者雨宫本想对加美拉进行催长手术，好让它尽快长大足以抵抗恐怖怪兽的袭击，没想试验还在进行的时候，积达士再次在名古屋登陆，直接给研究所杀了个措手不及，成长不完全的透透，也只好再度迎战。而此时的小透，正在赶往名古屋的路上，他明白到守护石必须回到透透身上，才能让透透发挥出最大的力量。
　　可是小透徒步实在太慢了，麻衣也心急如焚要亲自送守护石回去，却被父母和医生劝阻，透透面对积达士完全没有还手之力，这下子可危险了……！