无线科幻悬疑剧〈迷离档案〉，带您追查一宗宗无法解释的诡异个案，揭开一些不可思议力量的神秘面纱！
　　高永贤（罗嘉良）为大学生物化学系教授，头脑冷静，笃信科学，反对迷信；文嘉利（张可颐）则是电视台信息节目的资料撰稿员，因曾亲历奇遇，所以对世上怪异的事皆「宁信其有，不信其无」。
　　二人机缘巧合下一起合作，共同尝试寻找一些诡异个案的真相，其「天才白痴」、「轮迥」、「降头」、「邪教」、「异度」及「人间蒸发」等。二人在合作过程中，因所持观点有分歧，因此不时发生冲突，误会重重，但最终仍互相体谅，更渐渐成为情侣。一次，利为救贤而误丧刀下，贤为求利死而复生，须勇闯四度空间……

　　李大有（黄日华）和李奇（曾江）父子，数名黑帮头子合作讨债公司，由于大有的方式以凶狠出名故为欠债人闻风丧胆。
　　郑继凤（尹扬名）因一次交通意外，为救四子而使妻惨死，因而四年来不断自责，但其自小便不得其父郑森喜爱，国小毕后便被父安排于马房任马夫。钱浅（陈秀雯），钟爱玲（蔡少芬）合开一家小公司，因投资失败而负债累累，在有有的讨债公司不断恐吓下，二人几乎走投无路。
　　钱、玲赛马日入场一搏，可惜血本无归，玲以为穷途末路时，却见浅又再拿出大笔金钱投注，始知她一直暗藏私己而继凤听信哥继龙的话，输光身上所有金钱，始知龙是戏弄他。浅、玲和有相处后，发觉并非想像中的残暴后更合作发展卡拉OK的生意。有发觉赛马生意必定发财，遂与黑道头子合作，果然赚了大钱。有决定亲自参与赛事，自当马主，而拜访潦倒练马师林登（李家鼎），但当有有邀凤参与时却引起其之恶感。
　　浅与有相处后，不自觉对他用了真情而玲亦同样爱慕有，同时有亦对浅产生好感。有购进之马匹“发梦王”悍难驯，幸得马师一鸣耐心训练，终于跑出不错成绩。另一方面大亨保罗对凤很欣赏，凤因感知遇之恩，遂对保罗卖命。小蓝至马场参观与凤相识，蓝更终情于凤，凤因郊鬻C微而不敢领情。
　　有和浅感情渐进稳定，而论结婚，于结婚前夕有发现浅吞公款，浅以为婚事告吹而卷款潜逃，此时大因经营遇上危机，而宣告破产，其后忽觉有负玲的爱，而和玲结婚有准备重振旗鼓，向冠鹤挑战，而冷落爱玲，终于有大获全胜，随即要与玲完婚，但内心对浅无法忘情。友有集结各富豪资金，准备于大陆兴建马场，但因政府抨击赛马赌博化，而导致有和凤双双身亡.

　　一个是上海知青子女——文嘉，一个是东北小镇青年——东阳。机缘巧合使他们相逢于上海，又是命运的拨弄，将两人的初次见面变成了生与死的隔离……生与死的经历只是一切的开始，在上海这座城市里：职场、情感、生存、事业、梦想、诱惑等等一系列现实层面的问题才是他们将要面临的最大考验。魔 都的魅力不仅吸引了他们，还有对他们灵魂的洗涤。面对种种选择使得这两个年轻人的命运轨迹离合交错，而真正的幸福到底是什么？也许每个人都会从文嘉与东阳的经历中找到自己的答案……

　　卖莱仔因铜（王祖蓝 饰）貌不惊人，却有一副好歌喉，渴望有朝一日一曲成名。经过內心反复挣扎，参加了歌唱比赛，最终因相貌丑陋遭人白眼，从此诸事不顺。一天，因铜偶遇美女杨仙嬅（苟芸慧 饰），杨并未因他的丑陋离开他，反而对他坦诚相见，因铜大受感动，对其心生爱意。死党蔡卓严（林子善 饰）有意成全，怂恿因铜大胆示爱，伹生性不善言辞的他在仙嬅问他喜欢自己什么时，他竟张口结舌，说了一些很浮浅的话，致仙嬅误以为他是个只重外表的庸俗男人，转身离他而去。深受打击的因铜误食神奇朱古力，摇身一变成为俊男力信（黄宗泽 饰），伹此药二十四小时后失效，他将变回原形，所以，他的愿望必须在药力失效前完成，好戏开始了……

　　故事发生在当代的香港长洲。而立之年的张保生（黄浩然 饰）有两个志趣相投的、情同手足的朋友，他们是当医生的程礼荣（陈展鹏 饰）和当邮差的陈满基（扬明 饰）。街坊会主席胜妹委派保生协助美国回港的电视制作人郑抱抱（陈茵微 饰）拍片，无奈保生才疏学浅，笑话百出。礼荣在一次医疗事故中遭人陷害，后在老医生关心仁（周聪 饰）开导下终成长洲仁医。此时，当年绝他而去的恋人希雯（李诗韵 饰）重返长洲，重新相见，两人百感交集。希雯决定洗尽铅华重新创业，礼荣母亲刘妙莲（卢宛茵 饰）怕儿子旧情复燃，极力阻止其接近希雯。保生为阻止他所认为的抱抱与胜妹的“奸情”，结果弄巧成拙。保生的妹妹文凤（乐瞳 饰）一心要踏入演艺圈，不料，唱片公司总监早已对她起了色心......

　　何奇通（郭蔼明 饰）是“奇通私家侦探社”的负责人，在一次帮助一名女子搜集她的警察丈夫出轨的证据时，与警察耀祖（郭晋安 饰）相遇了。耀祖处处帮助同事掩饰婚外情，令到奇通对他这种臭男人十分讨厌，认为他也是一路货色。奇通的父亲在她小时候就是因婚外情出走，留下母亲郁郁而终，而奇通也只得在侦探社负责人德叔（秦沛 饰）的照料下长大，所以奇通生平最痛恨出轨的男人。终于奇通完成了任务搜集够了证据，却与耀祖结下了梁子。随后，奇通重遇了中学好友宝怡（汤宝如 饰），更得知宝怡竟是耀祖女友，奇通处处提醒宝怡要提防耀祖，更教她跟踪术，搞得耀祖不胜其烦。一次耀祖因工作需要出入色情场所被奇通拍下了照片，阿怡拿着照片想耀祖质问，令耀祖工作受到了影响，自此他更是讨厌奇通。
　　随后阿怡怀上了身孕，准备和耀祖结婚，岂料结婚当日阿怡却突然失踪了。深爱阿怡的耀祖四出寻找，最后因旷工多日被开除出警队。奇通可怜耀祖，觉得自己对他搞成这样也负有一定责任，于是通过德叔邀请耀祖加入他们的侦探社，耀祖一方面想找回未婚妻，一方面迫于生活压力，最终加入了侦探社。于是，他们开始了一段又一段情事缉私档案。