Muv-Luv ATE全名为《Muv-Luv Alternative Total eclipse 》，全集动画片改编自《Muv-Luv Alternative》的外传小说。故事的时间设定在西元2001年，由于人类遭到地球外起源种(联合国称其为BETA)的侵略，正面临灭亡的危机，因此人类开始了先进战术机技术开发计划“XFJ计划”，各个国家均派遣了专门人员参与其中，该作讲述的就是这些被派遣过来的人员之间的故事。
　　（有虫子吃掉妹纸情节,反差极大,请谨慎观看.）

　　メモリー ズオフ3.5〜想い出の彼方へ〜 Vol.1 （2004年5月12日発売）
　　メモリーズオフ3.5〜想い出の彼方へ〜 Vol.2 （2004年6月23日発売）

　　青野月音（岸尾大辅 配音）是一个平凡的高中男生，在升学考试之中，月音发挥失常，导致了无学可上的尴尬局面，就在此时，一间名为阳海学园的学校向月音抛出了橄榄枝，这是月音继续接受教育唯一的希望了，月音当然毫不犹豫的接受了。
　　然而，阳海学园可不是什么普通的学校，这是一所专门供给各种各样的妖怪们学习的学校，照理来说，人类是不可以进入校园的，一旦被发现真实身份，便会被妖怪们杀死。一次偶然中，月音邂逅了名为萌香（水树奈奈 配音）的吸血鬼少女，萌香意外的发现月音的血有着至高无上的美味，于是决定帮助月音隐瞒身份，在这所学校里生存下去。

　　新野爽歌（浅仓杏美 配音）一直将成为一名演员当做自己的梦想，尽管她的样貌平平，但出色的演技却吸引了铃木辉（小田久史 配音）的注意，同时喜欢着辉的还有完美的千金大小姐伊藤千寻。
　　默默喜欢着千寻的，是大少爷铃木忍（岩崎了 配音），然而，因为爽歌的离去，辉闷闷不乐，为了陪伴辉，千寻背叛了她和忍就读于同一个高中的誓言，一直守候在辉的身边。一晃眼两年过去，当辉再见到爽歌之时，她已经如愿成为了明星，然而，辉发现，爽歌失意了，并且已经有了恋人，而千寻亦和忍重逢，四人之间复杂又苦涩的故事，这段纠葛不清的四角恋还没有完结。

　　永井（铃村健一 配音）一直将对学弟斋藤（远近孝一 配音）的爱慕埋藏在心底，直到有一天，他得知了斋藤结婚的消息，伤心的永井只能闷声将自己灌醉。晕头转向的他在街上偶然遇见了贤三（森川智之 配音），面对这个可怜的男人，贤三只得将他带到附近的旅馆中休息。接着酒劲儿，永井和贤三接吻了，两人的不解之缘就此展开。就在两人的感情日渐升温的时候，愁眉苦脸的斋藤回来了。一边是曾经背叛自己和别人结婚的学弟，一边是危难时刻一直支撑着自己的情人，优柔寡断的永井一时间难以做出抉择，而就在这个节骨眼上，永井的前女友凉子（泷本富士子 配音）居然也强势回归了，四人之间剪不断理还乱的感情会有怎样的发展呢？

　　健二和雪希是情同手足的兄妹两，日和是两人青梅竹马的好友，三人常常聚在一起打发空闲的时光，留下了十分美好的童年回忆。然而，某一天，日和突然不告而别，没有留下任何联系方式，也没有告诉健二和雪希自己要搬到哪里去。就这样，日和仿佛蒸发了一样从兄妹两人的生命轨迹中消失了，两人关于日和的记忆也随着时间的流逝而渐渐淡去。
　　一晃眼多年过去，健二和雪希都考上了高中，即将开始洋溢着青春气息的高中生活。一天，健二房间的衣橱里发出了奇怪的声音，让健二没有想到的是，打开衣橱后，里面躲着的竟然正是日和。和他的突然消失一样，日和突然回到了健二和雪希的身边。

　　水银灯和真红两人从最初相遇到反目成仇的过程。共前、后两篇。

内详