神奇阿呦第二部全集故事讲述的是在神奇阿呦第一季最后一集中阿呦为了给小米去掉颜料，前往别的星球，机器流星人利用阿呦的善心逃脱，却引来了一个真正的流星人阿巴。阿呦把流星人阿巴带回小米家，但小米嫌它吵，阿巴就跑出去了。阿巴觉得实现别人的愿望很难，很伤心，想要回宇宙。
《如意兔之红晶石》主要讲述了为保卫 天城 家园，阻止冥王堡人掠夺天城“ 红晶石 ”宝矿的阴谋，守宝家族的水爷爷秘密地将开启宝矿的5件法宝分别交给了火龙、金灵、水花、木瓜和土生。从此这5个少年与天城命运和宝矿存亡紧紧相连。其次，金灵就是冥王堡的公主。勇敢的“五行少年”经历种种困难，并且还让天城人醒悟了，原来懦弱、自私的如意兔市民站了出来，依靠团结最终打败了冥王堡人，保住了天城自己美丽的家园。在主人公历经艰难曲折的保卫战中，让观众受到了环境安全、城市安全的大安全教育，同时也揭示出了保护绿色环境的深刻主题。
