在这次的故事中，火星娃和他的小伙伴们一起驾驶机器人，与魔狼军团进行了新一轮的战斗。自从魔晶岛的历险之后两年，小星和阿左等人都回到了现代的地球，在阿左居住的城市中平静的生活着。大家都以为从此可以过上安静平和的生活。谁知，来自火星的侵略者魔狼和他的手下邪恶博士伽玛、爪牙肥蛋、大头鸡等依然潜伏在地球上。他们以一家生产玩具的工厂为掩护，实则却在地下建立了一个秘密的基地。这些邪恶的入侵者觊觎着不知隐藏在何处的神秘魔力水晶，妄图凭借着魔力水晶的力量实现自己统治全宇宙的野心。
顶级武者步惊云与聂风，为了应对一场将要席卷整个人间的浩劫，在无名前辈和神秘天外来客的帮助下变成量子态后，下落不明。三千年后，一颗小行星撞击地球，地表成为一片荒蛮的废土。 被困在地下的人类，逐渐发现在人体内存在著名为"脉能"的超能力量。 来自32号地下城的孤儿步天云，意外唤醒了沉睡在陨铁之中的步惊云，从此发现了自己体内的“脉能”潜力，并与聂风传人聂子风一起，走上了成为“脉能武者”的历练之路，为守护世界而战。
打倒“妖神颂五力”的三年后，马场柠檬已经是国中生。某日，阿拉拉城空中突然出现了巨大奇怪物体…
もう『器用貧乏』なんて言わせない！ いつか『万能者』と言われる探索者になってやる！ ある日のこと…… 所属している「勇者パーティ」のリーダーであり、幼なじみのオリヴァーから 実力不足を理由に追放を言い渡されたオルン・ドゥーラ。 パーティのために【剣士】から【付与術士】へとコンバートし、 独自に開発した魔術で仲間をサポートしてきたオルンにとっては到底、 納得のいくものではなかった。 しかし、苦楽を共にしてきたはずの仲間からも『器用貧乏』だとバカにされ、 すでに後任者も決まっているという。 失意のなか、「勇者パーティ」に別れを告げたオルンは探索者としての決意を新たに、 ソロ活動を始めるのだが……。 抜け落ちた記憶… 理不尽さへと立ち向かう力… 新たなる出会いの数々が、オルンの運命を大きく変える。 大切な仲間を護るため 究極の『器用貧乏』は、最強の『万能者』を目指して突き進む。 大逆転の異世界王道ファンタジーが開幕！
1998年夏季，拥有预测型未来视的女孩濑尾静音（井口裕香 配音）邂逅伽蓝之堂的黑桐干也（铃村健一 配音）。从对方口中，她了解到未来视的真相，心中的疑惑和焦虑也烟消云散，但同时也看到了干也悲剧性的未来。另一方面，拥有测定型未来视的职业炸弹狂魔仓密目琉夏，利用自己构建的未来制造一系列恐怖袭击事件，直到他遭遇冷静干练的两仪式（坂本真绫 配音），命运的齿轮开始转动。转眼来到2010年，失去了未来视能力的瓶仓光瑠（石田彰 配音）转行做了绘本画家，命运安排他和两仪式及其女儿未那（金元寿子 配音）相逢，此后他和崇拜自己的未那拜访了传奇占卜师观布子之母…… 本片根据奈须蘑菇以及武内崇创作的同名原作改编。
2055年。手のひらサイズの小型ロボット「LBX」は世界最高のホビーと称され、プロリーグの設立などビジネスにおいても大きな存在感を放つ時代となっていた。そんな中、選りすぐりのプレイヤーが集うLBXのための学校「神威大門統合学園」に転入した少年、『瀬名アラタ』と『星原ヒカル』を待っていたのは、想像を超える出来事であった。学園の地下に広がる、直径10kmの巨大ジオラマ。放課後にそこで繰り広げられる、「ウォータイム」という学園独自の謎の規則。そして、LBX完全破壊（ロスト）による退学…。クラス委員長『出雲ハルキ』のチーム「第1小隊」に配属されたアラタとヒカルは、転入した2年5組、通称【ジェノック】のLBXプレイヤーとして、幾多の思惑が渦巻く学園の謎を背景に、壮絶な運命へと身を投じる――！
